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バイオステーションは、最新の生命科学研究を分かりやすくお伝えすることを目指します。 ポッドキャスト📻(https://podcasters.spotify.com/pod/show/biostation6)
バイオステーション









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エンハンサーRNAからタンパク質ができる? エンハンサーRNA(eRNA)は長く非コードRNAと思われいたが、一部のeRNAがタンパク質へと翻訳されること、それらがde novo(新規)遺伝子誕生に関わる可能性を報告。アルギニンに富み、細胞核内に多いんだとか エンハンサーからもタンパク質が、 www.cell.com/trends/genet...
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Enhancer RNAs (eRNAs) are short, unstable RNA polymerase II transcripts from active enhancers processed by the Integrator complex. Once considered noncoding, recent work from Vlasov et al. shows that…
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Emergence of protein-coding enhancer RNAs in primate evolution
超並列の生化学解析を可能する新手法(APB-Display) ハイドロゲルビーズに目的のタンパク質を発現させ、FACSとNGSと組み合わせることで、数万以上のタンパク質親和性を一気に解析することを可能に。タンパク質の配列と機能の相関を予測するための機械学習モデルの構築へ www.biorxiv.org/content/10.6...
リソソーム修復を司る新因子LASER 損傷したリソソームの修復に関わる因子として、ゲノムワイドスクリーニングからLASER複合体を同定。リソソーム損傷を検知して膜修復因子をリクルートするらしい。神経変性疾患とも関連するらしい www.nature.com/articles/s41...
細胞核-ミト相互作用によるエネルギー制御 ミトコンドリアがテザリング因子RANBP2とVDAC1を介して、核膜孔と物理的に結合することを発見。ATPやホスホクレアチンなどの分子の核内輸送に貢献し、この相互作用の阻害でヒストン修飾や細胞分化に影響がでる 核-ミトも相互作用! www.nature.com/articles/s41...
mRNAの非翻訳領域がシャペロンとして働くかも 保存された配列を持つ3'UTRが、天然変性領域を持つタンパク質の凝集などを防ぎ、活性を維持するために重要であることを発見。3'UTRが欠損するとタンパク質が適切に折り畳まれず、量や局在は変わらなくても活性が減少 驚きです、、 www.cell.com/cell/fulltex...
深層学習による相分離凝集体の解析 顕微鏡画像から核小体や核スペックルなどの凝集体の特徴を抽出する技術Deep-Phaseを確立。核小体が花のようになるフラワー型構造やその形成機序を発見。rRNAの形成と成熟のバランスが重要らしい www.cell.com/cell/fulltex...
爆発的細胞死「ラプトーシス」 プラナリアで、細胞が爆発する細胞死を起こし、周囲の細胞を死滅させる免疫系として働くことを発見。分泌細胞由来の細胞によって担われ、進化の初期から存在する生体防御機構である可能性。ホルモンによって制御されるらしい www.cell.com/cell/fulltex...
即時型老化細胞による傷の修復 組織損傷後に、転写に依存せず翻訳ですばやく制御される即時型の老化細胞が存在することを発見。この細胞は炎症性因子や細胞移動を促す因子を放出し、組織の再上皮化と再生を促進するらしい 翻訳での制御というのも面白いです www.nature.com/articles/s41...
髄膜は意外に多機能 髄膜の発生過程をシングルセル解析で明らかに。髄膜と脳の神経系は相互作用しながら発達し、例えば軟膜の線維芽細胞が免疫細胞の配置に貢献したり、TREM2陽性のマクロファージが神経細胞の発生を制御したりするらしい www.cell.com/cell/fulltex...
核内の細胞骨格因子による幹細胞運命制御 プロテオミクス解析により、通常細胞質に存在する細胞骨格タンパク質が神経幹細胞の核内に存在することを発見。クロマチン因子と相互作用することで、幹細胞運命を制御するらしい。神経発達疾患との関連も www.cell.com/cell/fulltex...
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www.biorxiv.org
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ATG8 conjugation on damaged lysosomes triggers rapid assembly of a protein complex containing TFG, which directs lysosomal membrane repair by recruiting ESCRT proteins to sites of damage.
LASER couples damage sensing to ESCRT assembly for lysosome repair - Nature
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Mitochondria interact directly with the nuclear pore complex via VDAC1–RANBP2 binding to sustain nuclear ATP levels.
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Mitochondria directly interact with the nuclear pore complex - Nature
Explosive cytotoxicity of ruptoblasts bridges hormone surveillance and immune defense
Ruptoblasts are a cytotoxic glandular cell type that undergoes explosive cell death, ruptosis, releasing potent, broad-spectrum agents capable of killing nearby cells. Ruptosis is triggered by the…
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A deep learning method quantitatively decodes nucleolar, nuclear speckle, and viral condensate morphology to reveal underlying biochemical states. Applying this framework reveals a previously…
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Deep learning of functional perturbations from condensate morphology
Nuclear proteome reveals microtubule-associated protein regulating fate and disease
Nuclear and cytoplasmic proteomics uncover a nuclear pool of cytoskeletal proteins, including MAP1B, whose shuttling to the nucleus increases BRG1/BAF chromatin association and regulates brain…
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Transcription-independent induction of rapid-onset senescence is integral to healing - Nature Cell Biology
Valdivieso, Rozmaric et al. show that wounding rapidly induces a senescent state in skin cells involving p21 protein induction, without the need for new transcription. These senescent cells are…
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A spatiotemporal atlas of the human meninges during early-to-mid gestation identifies asynchronous layer development and transcriptomic features of meningeal cells and demonstrates that pial…
Decoding the spatiotemporal development of human meninges
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Highly conserved mRNA 3′ UTRs act as co-translational chaperones for intrinsically disordered regions (IDRs), preventing inter-domain misfolding and enabling biogenesis of fully active proteins.
mRNA 3′ UTRs chaperone intrinsically disordered regions to control protein activity